ریڈیو فریکوئنسی شناختی نظام کے بنیادی ورکنگ موڈ کو مکمل ڈپلیکس (فل ڈپلیکس) اور ہاف ڈپلیکس (ہاف ڈپلیکس) نظام اور ترتیب (ایس ای کیو) نظام میں تقسیم کیا گیا ہے۔ فل ڈپلیکس کا مطلب یہ ہے کہ ریڈیو فریکوئنسی ٹیگ اور قاری ایک ہی وقت میں ایک دوسرے کو معلومات منتقل کر سکتا ہے۔ نصف ڈپلیکس کا مطلب یہ ہے کہ ریڈیو فریکوئنسی ٹیگ اور قاری دونوں سمتوں میں معلومات منتقل کر سکتا ہے، لیکن معلومات کو ایک ہی وقت میں ایک سمت میں منتقل کر سکتا ہے.
فل ڈپلیکس اور ہاف ڈپلیکس سسٹم میں، ریڈیو فریکوئنسی ٹیگ کا جواب قاری کی طرف سے خارج ہونے والے برقی مقناطیسی میدان یا برقی مقناطیسی لہر کے تحت باہر بھیجا جاتا ہے. کیونکہ خود قاری کے سگنل سے موازنہ کیا جائے تو موصولہ انٹینا پر ریڈیو فریکوئنسی ٹیگ کا سگنل بہت کمزور ہوتا ہے اس لیے ریڈیو فریکوئنسی ٹیگ کے سگنل کو قاری کے سگنل سے ممتاز کرنے کے لیے ایک مناسب ٹرانسمیشن طریقہ استعمال کرنا چاہیے.